疾病对小儿生长发育的影响也十分明显，急性感染常使体重不增或减轻，慢性感染则同时影响体重和身高的增长。内分泌疾病(如甲状腺功能减退症)对生长发育的影响更为突出，常引起骨骼生长和神经系统发育迟缓。先天性疾病(如先天愚型)对小儿体格发育和智力发育都会产生明显影响。
影响小儿生长发育的因素有以下几方面：
一、 遗传：遗传因素对小儿的生长发育有一定影响。如父母身材的高矮、皮肤的颜色、毛发的多少以及形态等，对子女都有一定程度的影响。
二、 精神因素：专家认为得不到抚爱的儿童，由于体内分泌的生长比较少，故他们的平均身高可能低于同龄儿童。
三、 营养：营养对生长发育至关重要。婴幼儿期需要合理的饮食结构，否则不但影响正常发育，而会影响日后的智能。
四、睡眠：儿童入睡后，脑垂体的前叶就能分泌出一种生长。如睡眠不足，生长就可能受阻，形成精神性侏儒症。
五、 锻炼：利用自然条件进行体格锻炼对增强儿童体质，提高发育水平和降低发病率有很大作用。日光、空气、水能促进新陈代谢、消化、吸收和血液循环，有利生长发育。
六、 疾病：长期消化功能紊乱、反复呼吸道感染、内分泌系统疾病以及大脑发育不全等，对小儿生长发育都有直接影响。
七、 环境和气候：人体学研究已经证明，秋季长重，春季长高。从地区来看，热带发育较早，寒带生长迅速。此外，合理的生活制度、清鲜空气、没有噪音和污染的环境，均有利于小儿体格和精神的发育。
性早熟是儿科内分泌系统的常见发育异常，是指女童在8岁前，男童在9岁前呈现第二性征发育的异常性疾病。中枢性性早熟（CPP）是缘于下丘脑提前增加了促性腺释放（GnRH）的分泌和释放量，提前性腺轴功能，导致性腺发育和分泌性，使内、外生殖器发育和第二性征呈现。CPP又称为GnRH依赖性性早熟，其过程呈进行性发展，直至生殖系统发育成熟。
小儿性早熟病因
1.系统器质性病变。
2.外周性性早熟转化而来。
3.特发性CPP（ICPP）无器质性病变。女性患儿80%～90%为ICPP；男性患儿则相反，80%以上是器质性的。据推测，这部分性早熟病儿与环境内分泌干扰物的刺激有很大关系。